Wybór formatu leży w gestii użytkownika, standardem stał się MP3, ale konkurencja, choć mniej popularna, oferuje często lepszą jakość dźwięku przy zachowaniu tego samego stopnia kompresji. Aby przenieść muzykę z CD na odtwarzacz przenośny należy posłużyć się oprogramowaniem dostarczanym najczęściej wraz z urządzeniem.
W sposób łatwy i szybki skopiuje ono zawartość płyty do pamięci komputera, a później poddaje kompresji na docelowy format. Przed rozpoczęciem pracy wystarczy tylko wybrać odpowiadający naszym wymaganiom stopień upakowania danych, im większy, tym więcej materiału pomieści odtwarzacz, ale tym niższa będzie jakość muzyki.
W niektórych systemach, najczęściej mini wieżach, ale także amplitunerach czy rejestratorach DVD, montowane są gniazda USB oraz specjalne układy, które pozwalają podłączyć odtwarzacze przenośne bez pośrednictwa komputera.